本院包含四個中心、一個學士學位學程
西灣學院由下列四個教育中心與一個學程組成： 1. 基礎教育中心 2. 博雅教育中心 3. 運動與健康教育中心 4. 服務學習教育中心 5. 人文暨科技跨領域學士學位學程
基礎教育中心致力於培育大一、大二學生基本能力與素養，在學生發展系所專業能力的同時，引領學生探索最適性的學習領域與方向，期望學生能在跨領域的學習經驗中發掘自己的特殊能力。亦推動資訊素養及程式設計教學，提升學生程式設計及運算思維之基本素養，創造更多跨領域發展加值應用的契機；更致力落實以「學習主體」為中心的理念，發展跨領域微學分工作坊、募課平台、大學之道生活營及宿舍共學等創新教學，提供豐富多元的學習機會，以切合學生真正學習需求，營造自主學習、跨域交流討論的學習風氣，均衡人文、社會與科學之基本素養。
本中心致力於推動知識跨域整合，發展「主題式博雅」課程，孕育學生跨界學習能力；持續推動通識教育架構實施暨精進課程品質、加強跨域交流及深化學生在地連結、社會實踐能力。
本中心主要負責推展本校「運動與健康」相關課程，課程目的在培養學生身體活動能力、體適能、運動技能及運動參與等。透過身體活動與運動，可以幫助健康促進並提升生命品質，這對於本校培養未來社會菁英與領導階層的理念，具有相輔相成的效果。
本中心服務學習課程為一學分必修課程，具有在地性、多元性、體驗性的特色，整合為科普教育、弱勢關懷、公民社會、社區創新、國際志工及校內服務六大類， 以此落實服務學習連結大學社會責任，並開拓多元化國際志工，培養學生參與世界公民、增加國際視野及提升國際競爭力，將持續開拓多元化國際志工類課程，服務拓展至日本與尼泊爾、柬埔寨---等東南亞國家。
因應跨領域人才培育需求、培養學生具備解決複雜社會問題的能力，以提升學生就業競爭力，中山大學在107學年度成立「人文暨科技跨領域學士學位學程」，讓有創新設計與創業理念、對於社會人文與當代科技有興趣的同學，有一個跨域學習的管道；課程著重與「共學群」合作開設議題導向式的專題課程，並強調實作能力的養成。
整合國立中山大學教學與研究資源，以推動公民素養調查與相關的學術研究和活動。
國立中山大學位於高雄這座國際級的大型海港城市中，且鄰近左營國家訓練中心，具絕佳的地理條件。設置「運動健康產業研究中心」，對於體育學術及運動健康產業研究，可透過承接國家重大專案計畫，逐步成為我國體育學術研究的領航者。
